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Title: Identificação de proteínas exclusivas de fitopatógenos da família Xanthomonadaceae : uso de genômica comparativa para identificação de novos alvos de combate.
Authors: Assis, Renata de Almeida Barbosa
metadata.dc.contributor.advisor: Moreira, Leandro Marcio
Guttman, David S.
Keywords: Plantas - compostos bioativos
Bactérias fitopatogênicas
Genômica
Sistema imunológico
Coevolução
Issue Date: 2016
metadata.dc.contributor.referee: Moreira, Leandro Marcio
Garcia, Camila Carrião Machado
Laia, Marcelo Luiz de
Citation: ASSIS, Renata de Almeida Barbosa. Identificação de proteínas exclusivas de fitopatógenos da família Xanthomonadaceae : uso de genômica comparativa para identificação de novos alvos de combate. 2016. 88 f. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) – Núcleo de Pesquisas em Ciências Biológicas, Universidade Federal de Ouro Preto, Ouro Preto, 2016.
Abstract: A família Xanthomonadaceae compreende espécies diferentes de proteobactérias não patogênicas e patogênicas que infectam diferentes hospedeiros, incluindo humanos e plantas. Nesse estudo, foi realizado uma análise comparativa usando o genoma completo de 69 cepas bacterianas pertencentes à família Xanthomonadaceae com foco na identificação de famílias de proteínas exclusivas de fitopatógenos que poderiam justificar o estilo de vida e a capacidade desses microrganismos infectarem hospedeiros compatíveis. Foram identificadas sete famílias de proteínas fitopatógeno-específicas, todas supostamente secretadas pelo sistema secretório tipo II: PheA (CMs), LipA/LesA, VirK, e quatro famílias de proteínas envolvidas na degradação de N-glicanos, NixE, NixF, NixL e FucA1. Análises filogenéticas e in silico dessas famílias de proteínas revelaram que todas elas possuem ortólogos em outras bactérias simbióticas ou patogênicas de plantas e estão envolvidas na modulação e evasão do sistema imune. Uma vez que esse estudo inclui microrganismos estreitamente relacionados, com estilos de vida diferenciados e evidencia proteínas diretamente relacionadas com adaptação dentro dos tecidos vegetais, abordagens inovadoras podem ser implementadas visando não somente a utilização destas proteínas como alvos biotecnológicos para o controle da doença, mas também contribuindo para a nossa compreensão da coevolução de bactérias associadas a plantas.
metadata.dc.description.abstracten: The Xanthomonadaceae family consists of different species of non-pathogenic and pathogenic proteobacterias that infect different hosts, including humans and plants. In this study, we performed a comparative analysis using complete genomes of 69 bacterial strains belonging to Xanthomonadaceae family, with a focus on identifying phytopathogens unique protein families that could explain the lifestyle and ability of these bacteria to infect compatible hosts. We identified seven phytopathogen-specific families, all putatively secreted by type II secretory system: PheA (CMs), LipA/LesA, VirK, and four families involved in N-glycan degradation, NixE, NixF, NixL, and FucA1. In silico and phylogenetic analyses of these protein families revealed that, they all have orthologs in other plant pathogenic or symbiotic bacteria and are involved in the modulation and evasion of the immune system. Since this study includes closely related microorganisms with distinct lifestyles and highlights proteins directly related to adaptation inside plant tissues, novel approaches may be implemented that not only use these proteins as biotechnological targets for disease control, but also contribute to our understanding of the coevolution of plant-associated bacteria.
Description: Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia. Núcleo de Pesquisas em Ciências Biológicas, Pró-Reitoria de Pesquisa de Pós Graduação, Universidade Federal de Ouro Preto.
URI: http://www.repositorio.ufop.br/handle/123456789/8872
metadata.dc.rights.license: Autorização concedida ao Repositório Institucional da UFOP pelo autor, 27/09/2017, com as seguintes condições: disponível sob Licença Creative Commons 4.0, que permite copiar, distribuir e transmitir o trabalho, desde que seja citado o autor e licenciante. Não permite o uso para fins comerciais nem a adaptação desta.
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