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Title: Mapeamento físico dos retrotransposons boudicca e perere no genoma do Schistosoma mansoni.
Authors: Valentim, Cláudia Laignier Lage
metadata.dc.contributor.advisor: Babá, Élio Hideo
Keywords: Esquistossomose mansônica
Genomas
Genéticas
Biologia molecular
Issue Date: 2006
Publisher: Programa de Pós-Graduação em Ciências Biológicas. Núcleo de Pesquisas em Ciências Biológicas, Pró-Reitoria de Pesquisa e Pós Graduação, Universidade Federal de Ouro Preto.
Citation: VALENTIM, C. L. L. Mapeamento físico dos retrotransposons boudicca e perere no genoma do Schistosoma mansoni. 2006. 85 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de Ouro Preto, Ouro Preto, 2006.
Abstract: O Schistosoma mansonié o agente etiológico da esquistossomose, uma doença endêmica em vários países. O estudo do seu genoma, estimado em 270Mb é de grande importância para se entender a sua biologia, os mecanismos de resistência a drogas e sua variação antigênica. O mapeamento físico do genoma do S. mansoniestá sendo construído e a localização de genes pelas técnicas de FISH (Fluorescence in situhybridization) e PRINS (Primed in situlabeling), são estratégias utilizadas neste estudo, entretanto, há pouca informação disponível sobre estemapeamento. O principal objetivo deste trabalho foi a localização do retrotransposon Perere, com grande nível de expressão gênica e o Boudicca, que está presente em grande número de cópias, e que representam as famílias deretrotransposon, respectivamente, não-LTR e LTR. Os BAC clones 1A e 11A foram selecionados por bioinformática por apresentaram similaridade para o Perere e Boudicca, respectivamente. Utilizando cromossomos metafásicos obtidos a partir de esporocistos da cepa LE do S. mansonie as técnicas de FISH e PRINS foi possível, pela primeira vez, localizarfisicamente estes retrotransposons. O Perere foi localizado nas regiões de eucromatina do par de cromossomos homólogos 2 e o Boudicca, nas regiões de eucromatina dos cromossomos 2 e Z. Estas localizações abrem a perspectiva de se estudar a localização destes retrotransposons nas várias fases do ciclo de vida do parasito o que permitirá inferir sobre a transposição destes elementos para as demais regiões dos mesmos cromossomos, ou mesmo, para outros cromossomos. Uma vez observada estas variações na localização, poderemos inferir sobre a função destes retrotransposons nos mecanismos de variabilidade genética observada neste parasito.
metadata.dc.description.abstracten: Schistosoma mansoniis the main causative agent of schistosomiasis, an endemic disease in many countries. The study of its genome, expected in 270Mb is very important to understand its biology, the mechanisms of drug resistance and their antigenic variation. The S. mansonigenome physical mapping is under construction and genes localization by FISH (Fluorescence in situhybridization) and PRINS (Primed in situlabeling) are strategies used for this study, moreover, little information about this is actually available. The goal of this work was the physical mapping ofthe retrotransposons Perere, non-LTR, which presents high transcriptional activity and Boudicca,LTR, that presents high number of copies in S. mansonigenome. The BAC clones 1A and 11A were selected through bioinformatic analysis showing similarities to the retrotransposons Perere and Boudicca, respectively. By using metaphase chromosomes from S. mansoniLE sporocysts with FISHand PRINS techniques we were able, for the first time, to map these retrotransposons in the parasite’s chromosomes. Perere was localized ineuchromatin regions of the pair of chromosomes 2 and Boudicca in the euchromatic regions of chromosomes 2 and Z. From the mapping of these retrotransposons and studies about their localizations in different phases of parasite’s cycle we could infer about their transposition capacities. Once detected in different localizations during the phases of the cycle, we can infer the hole of these retrotransposons on genetic variabilities of the parasite.
URI: http://www.repositorio.ufop.br/handle/123456789/3330
Appears in Collections:PPCBIOL - Mestrado (Dissertações)

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