Navegando por Autor "Queiroz, Rafael Alves Bonfim de"
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Item Camoufaged nests of Mischocyttarus mirifcus (Hymenoptera, Vespidae).(2021) Milani, Lucas Rocha; Queiroz, Rafael Alves Bonfim de; Souza, Marcos Magalhães de; Clemente, Mateus Aparecido; Prezoto, FábioSocial wasps present various architectural patterns for their nests, which may difer in shape, size, color, and material used in construction. The distribution pattern of comb cells presented by Mischocyttarus mirifcus (Zikán, 1935) is vertical with a single cell of width, resulting in a fliform shape that camoufages in the middle of the substrate. There are few studies regarding this architectural pattern for social wasps and their role in camoufage, and this study aims to detail the nesting habits of this species. In total, 40 colonies were analyzed in their natural habitat and six were dissected in the laboratory. Aspects about the construction of the nests and nesting environment have been described. A test was carried out with nest photographs, to quantify their camoufage percentage within the nesting substrate. The colonies were found mainly in riparian forests where there were elements in the environment that favored their camoufage. According to the nest photograph analysis, their camoufage levels can vary according to the position from which the photograph is taken. It is evident that M. mirifcus founders select sites where they can camoufage their colonies, and this gives them advantages in exploring a new environment.Item Computational techniques to find and suppress bone from chest radiological images.(2023) Ziviani, Hugo Eduardo; Cámara Chávez, Guillermo; Silva, Mateus Coelho; Cámara Chávez, Guillermo; Queiroz, Rafael Alves Bonfim de; Oliveira, Thiago Eustaquio Alves de; Silva, Mateus CoelhoThe proposal of this work is to propose bone suppression techniques in chest images. The most common, but inaccessible, way is through Dual Energy Subtraction (DES). This the technique requires specific hardware to generate and receive di erent energy levels capable of di erentiating materials by atomic number. This work uses GAN to perform bone suppression on X-ray images and aimed to evaluate the performance of the cGAN, train a model to locate the thoracic box, and assess two di erent training techniques for boneless image translation. Based on deep learning the main contribution of this work is to improve the bone shadow elimination delimiting the learning region of the Deep Learning (DL) model. By the contextualization of the bones region, was possible present a metric that measures the model accuracy in an interested region. With this study was possible a more precise metric to evaluate the bone suppression quality. Using the Japanese Society of Radiological Technology (JSRT) this study achieved a PSNR index of 31.604, and a similarity coe cient, known as SSIM of 0.9402. When delimiting the learning region, the results were: 31.9136 for PSNR and 0.9633 for SSIM.Item Exploiting a loss and a synthetic dataset protocol for biometrics system.(2022) Silva, Pedro Henrique Lopes; Moreira, Gladston Juliano Prates; Luz, Eduardo José da Silva; Moreira, Gladston Juliano Prates; Luz, Eduardo José da Silva; Queiroz, Rafael Alves Bonfim de; Silva, Rodrigo César Pedrosa; Oliveira, Luciano Rebouças de; Santos, Thiago Oliveira dosOs sistemas biométricos são um assunto comum no cotidiano do ser humano. Os esforços para aumentar a segurança desses sistemas estão aumentando a cada ano devido à sua necessidade por robustez. Os sistemas baseados em uma modalidade biométrica não tem um desempenho próximo da perfeição em ambientes não cooperativos, o que exige abordagens mais complexas. Devido a isso, novos estudos são desenvolvidos para melhorar o desempenho de sistemas baseados em biometria, criando novas formas de ensinar um algoritmo de machine learning a criar novas representações. Atualmente, vários pesquisadores estão direcionando seus esforços para desenvolver novas abordagens de metric learning para arquiteturas de deep learning para uma ampla gama de problemas, incluindo biometria. Neste trabalho, propõe-se uma função de perda baseada em dados biométricos para criar representações profundas a serem utilizadas em sistemas biométricos, chamada de D-loss. Os resultados mostram a eficácia da função de perda proposta com a menor taxa de equal-error rate (EER) de 5,38%, 13,01% e 7,96% para MNIST-Fashion, CIFAR-10 e CASIA-V4. Uma estratégia diferente para aumentar a robustez de um sistema é a fusão de duas ou mais modalidades biométricas. No entanto, é impossível encontrar um conjunto de dados com todas as combinações de modalidades biométricas possíveis. Uma solução simples é criar um conjunto de dados sintéticos, embora a metodologia para criar um ainda seja um problema em aberto na literatura. Neste trabalho, propõe-se a criação de um critério para mesclar duas ou mais modalidades de tal forma a criar conjuntos de dados sintéticos semelhantes: o critério de Doddington Zoo. Várias estratégias de mesclagem são avaliadas: fusões ao nível de score (mínimo, multiplicação e soma) e nível de características (concatenação simples e metric learning). Um EER próximo a zero também é observado usando os critérios de fusão propostos com a fusão de soma de pontuação e as modalidades de Eletrocardiograma (CYBHi), olho e face (FRGC). Dois conjuntos de dados com mais de 1.000 indivíduos (UFPR-Periocular e UofTDB) são usados para avaliar os critérios de mesclagem junto com a D-loss e outras funções de metric learning. Os resultados mostram o aspecto do critério do Doddington Zoo de criar conjuntos de dados semelhantes (pequeno desvio padrão em relação ao critério randômico) e a robustez do D-loss (2,50% EER contra 2,17% da função de perda triplets e 5,74, da função de perda multi-similarity).Item Sequenciamento e genômica comparativa de Curtobacterium flaccumfaciens isolado 208 como atributo biotecnológico de busca por genes de virulência e adaptação.(2024) Ribeiro, Dilson Fagundes; Moreira, Leandro Marcio; Sanchez, Angelica Bianchini; Moreira, Leandro Marcio; Queiroz, Rafael Alves Bonfim de; Ferreira, Cyntia Silva; Theodoro, Gustavo de Faria; Nunes, RhewterIsolados bacterianos cultiváveis associados a plantas no Quadrilátero Ferrífero demonstraram ser capazes de remover ou biotransformar o arsênico do solo, auxiliando assim no crescimento das plantas. Um desses isolados foi identificado como Curtobacterium flaccumfaciens 208 (Cff208). O objetivo deste trabalho foi investigar a possibilidade de Cff208 atuar como causador de doenças no feijão, e entender as possíveis diferenças genômicas que possam justificar sua adaptação como endofítico de uma planta cactácea, uma vez que as bactérias desta espécie estão associadas a grandes perdas agrícolas nas culturas de feijão e soja. Inoculado em feijoeiro (Phaseolus vulgaris), Cff208 mostrou-se incapaz de promover sintomas, sendo caracterizado, portanto, como não virulento para feijoeiros. Seu genoma foi completamente sequenciado e comparado com outras 34 isolados de pandistribuição, mostrando-se muito semelhante a genomas de linhagens virulentas, com um genoma central (core) de 2426 genes (68,4±3,7%). Apenas 84 genes foram identificados como exclusivos para Cff208 (2,3% do genoma), a maioria inserida no único plasmídeo que não apresenta genes putativos associados à indução de virulência, ao contrário dos plasmídeos descritos anteriormente para isolados patogênicas, que neste trabalho foram revelados como potenciais plasmídeos integrativos. Essa redução na diversidade gênica também foi observada nos genes que codificam enzimas hidrolíticas, metaloproteases, de resistência a antibióticos ou metais pesados, ou mesmo associados à síntese de metabólitos secundários, impossibilitando uma relação direta entre suas presenças e com indução de patogênese. A diferença mais marcante foi observada na composição de genes associados à síntese de pilus tipo IV, associada à motilidade tipo twiching ou gliding. A sua presença nas estirpes que as possuem, maioritariamente associadas a hospedeiros leguminosos, parece ser determinante na colonização do xilema e consequente entupimento do xilema, contribuindo assim para a promoção de sintomas. Por fim, a análise do genoma flexível demonstrou pela primeira vez em Cff como a propagação de sementes contaminadas contribui para a disseminação desse patógeno, corroborando assim o conhecimento empírico. A análise comparativa do genoma do Cff208, revelou que sua composição genômica é bastante semelhante à de outras isolados virulentas dessa mesma cultura, o que torna o patossistema ainda mais intrigante. Pela primeira vez relatados como potenciais alvos moleculares de indução de patogenicidade, futuras avaliações funcionais dos genes associados à síntese de pilus tipo IV tornaram-se essenciais para uma melhor compreensão da interação molecular desses potenciais patógenos e suas plantas hospedeiras.Item Sistemas do tipo difusao-reação e preservação de pontos singulares.(2021) Judice, Sicilia Ferreira Ponce Pasini; Santos, Ítalo Messias Felix; Chagas, Nilo Koscheck das; Loula, Abimael Fernando Dourado; Giraldi, Gilson Antonio; Queiroz, Rafael Alves Bonfim deMotivados por aplicações recentes em computação gráfica, este trabalho apresenta um estudo teórico e computacional de sistemas de difusão-reação baseados no Gradient Vector Flow (GVF), com foco no comportamento do GVF em relação às singularidades do campo inicial. O estudo teórico parte de uma análise local, independente de condições de fronteira. Em seguida, supõe-se condição de fronteira no infinito e usa-se análise de Fourier para estabelecer condições suficientes para preservação do ponto singular. Finalmente, supõe-se um domínio compacto, com geometria retangular, e analisa-se a preservação de um ponto singular em relação a condição de fronteira usando um método de solução de equações diferenciais parciais (EDPs) baseado em wavelets de Haar. Desenvolvemos também uma implementação de um método direto para a equação estacionaria do GVF baseado em diferenças finitas (DF) para comparar com a solução tradicional do Euler explícito, no que diz respeito a singularidade. E discutida a influência da vorticidade no problema de interesse usando a função de linhas de corrente e equação de Helmholtz. Nos experimentos computacionais, consideramos duas condições de fronteira, dois tipos de singularidades e os três métodos numéricos (Euler explícito, diferenças finitas para a equação estacionaria, e wavelets) para verificar os resultados teóricos obtidos.